La combinación de miconazole y clorhexidina poseen una actividad sinergica que mejora su espectro antimicótico y antimicrobiano. De manera individual, el miconazole inhibe la incorporación del ergosterol en las membranas celulares e incrementa las concentraciones de peróxido de hidrógeno citotóxico en el interior de la pared celular de los hongos. La clorhexidina altera el metabolismo energético y coagula el contenido celular bacteriano por contacto.